1、品级不同。总督一般是正二品，但巡抚却一般是从二品。当然，总督和巡抚都还有另加衔，但一般情况下，即使是有另加衔，也是总督经常另加“尚书衔”，兼都察院右都御史；而巡抚却是经常另加“侍郎衔”，兼都察院右副都御史。
2、所以，从中我们就不难看出，总督要比巡抚级别高。并且，都察院这个机构也就相当于咱们现在的中纪委，而其最高长官一般都是“右都御史”，而不是“右副都御史”。