不锈钢由于熔点较高，不会因高温溶化释出不良物质，但是不锈钢最怕强酸，如果长时间装载酸性较强的饮品，很可能会对其内胆产生损伤，造成保温不良。
此外，果汁不适宜高温保存，以免其营养物质遭破坏；且甜度高的饮料容易导致微生物大量滋生而变质。
干冰、碳酸饮料保温杯里不宜放干冰、碳酸饮料，避免内压上升，导致瓶塞无法打开或内容物喷出等危险。
不宜泡茶如果用保温杯泡茶，使茶叶长时间浸泡在高温、恒温的水中，就如用温火煎煮一般，茶中的维生素大量被破坏，芳香油挥发，单宁酸、茶碱大量浸出，不但降低了茶的营养价值，还会使茶汁无香味，茶味苦涩，甚至因为浸泡时间太久，茶叶可能会释出重金属物质，有害健康。
此外，保温杯长时间保温热茶时会变色，外出时建议使用茶包等来冲泡较为适宜。
不宜放盐分的流质（如盐水）因为保温杯的内胆都是喷砂电解过，电解之后的内胆可以避免水与不锈钢材质直接接触发生物理反应，而盐含有腐蚀性可能对其造成破坏，不适宜长时间装在被内。
不宜装牛奶、乳制品、果汁一些人会把热牛奶装在保温杯内，方便随身带着喝，不过，这种做法却让牛奶中的微生物在适宜温度下会迅速繁殖，导致腐败，容易引起腹泻、腹痛。
牛奶在高温环境下，维生素等营养物质会被破坏，同时牛奶中的酸性物质还会与保温杯内壁发生化学反应，影响人体健康。
不宜泡中药有些人也喜欢把中药泡在保温杯内，方便携带饮用。但煎好的中药一般溶解了大量酸性物质，容易和保温杯内壁所含的化学物质发生反应，并溶解到汤药里，对人体产生不良影响。
中药在25℃的温度下可以存放一两天，保温杯中温度较高，容易变质，建议常温存放即可。