保存在手机中的文档和程序，有两部分：
一部分保存在手机的内存、内置存储卡中，刷机的过程是用现在的ROM，即打包压缩后的程序，用它来覆盖原来的系统。刷机以后，原来的系统分区，即运行内存和内置存储卡中的程序还有原来用户自己安装的程序和文件都会被清除。
另一部分是保存在SD卡中的内容。刷机过程不会影响SD卡中的程序和内容，但是原来安装到SD卡中的程序在新的系统中是无法使用的。只能重新安装。所以在刷机前，备份的文件，除了通讯录和照片、图片、文档等，程序不需要保留。另外，现在软件助手比较成熟，安装软件非常方便，资源也丰富。刷机完成后，安装软件助手，很快就安装软件了。