(1)聚众扰乱社会秩序罪要求首要分子组织、纠集三人以上进行扰乱活动，一人或两人的扰乱活动，不能构成聚众扰乱社会秩序罪。破坏生产经营罪则不要求多人，一人就构成此罪。
(2)聚众扰乱社会秩序罪行为人的意图是想通过聚众扰乱，迫使机关、企业等满足其无理要求，侵害的客体是社会管理秩序，具体则是机关、企业、人民团体等单位的工作、生产及科研秩序。而破坏生产经营罪则是行为人出于泄愤报复或者其他个人目的，实施破坏机器设备等破坏生产经营的行为，侵害的客体是生产经营的正常活动动。
(3)扰乱社会秩序罪要求情节严重，并且造成严重后果，破坏生产经营罪则并不要求情节严重。
(4)聚众扰乱社会秩序罪虽然可能会存在正常的生产活动被破坏的情形，但这与破坏生产经营罪不一样，在破坏生产经营罪中，破坏正常的生产活动是行为人追求的直接目的，而在聚众扰乱社会秩序罪中，则由于行为人聚众扰乱，客观上造成了企业无法生产的结果，二者有着本质的不同。聚众扰乱社会秩序的犯罪嫌疑人必须是出于主观故意，如果是出于其他的目的而造成社会混乱的，如果是不构成犯罪的，就应当由公安机关进行治安管理处罚，处十五天以下的行政拘留，但是如果是构成其他犯罪的，就应当由人民法院进行刑事处罚。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》第二百九十条规定《刑事诉讼法》第八十九条公安机关对被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在拘留后的三日以内，提请人民检察院审查批准。在特殊情况下，提请审查批准的时间可以延长一日至四日。对于流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可以延长至三十日。人民检察院应当自接到公安机关提请批准逮捕书后的七日以内，作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。人民检察院不批准逮捕的，公安机关应当在接到通知后立即释放，并且将执行情况及时通知人民检察院。对于需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。