一般情况下，股权价格系买卖双方共同约定，无需与股东转让的出资额相等，股权转让备案登记的价格也无需大于等于转让股权的出资额。
根据我国《公司法》及相关法律除了对国有股权的转让价格作了实践中硬性规定外，对于其他的普通股权转让价格尚未作明确的规定。实务中，对于普通股权转让的价格确定有三种方式：
第一种方式，股东在转让股权时，其股权转让价款按公司工商注册登记的出资额确定，可称为“出资额法”。
第二种方式，股东在转让股权时，其股权转让价款按照公司资产评估后价格确定，可称为“评估价法”。
第三种方式，股东在转让股权时，其股权转让价款由转让方与受让方协商确定，可称为“协商价法”。对于股权转让价款的“协商价法”在实务中极其常见。原因在于“协商价法”的相对科学性，因为无论“出资额法”，还是“评估价法”，均反映企业资产的原有和现有资产价格，而股权的价值不仅体现企业资产的历史和现状，主要还应体现企业的未来收益，因此股权转让价格的确定应考虑企业的动态盈利能力。
法律并未要求股权转让价格不低于出资额，股权并购中，若出现股权转让备案登记的虚假股权转让价款与真实价款不相一致时，并购各方应注意采取相应措施保全证据，还原一个真实的股权转让价款，以防控法律风险。以避税为目的而简单将工商备案登记的股权转让价款改为股东出资额一致的处理方法一定程度上是对税收法律政策误解，并且存在极大的法律风险，因此并不可取。