法律分析：
可以。摩托车有合格证没有发票被交警扣了，如果仅仅是因为没有发票而被扣车的，就能要回来，如果是其他原因扣车的，能否要回来取决于能否提供交警所要求的应当提供的证件。
法律依据：
《机动车登记规定》 第七条 机动车的购车发票是进行机动车注册登记时必须提供的，用以证明机动车来历。