法律分析：依据2012年1月1日起施行的《行政强制法》第二十六条，因查封、扣押发生的保管费用由行政机关承担。行政机关往往与第三方约定，指定由第三方进行保管，在实践中由被扣押财产的当事人承担了这笔费用，损害了当事人的合法权益，当事人可以依法向法院提起诉讼。
《行政强制法》
第二十六条对查封、扣押的场所、设施或者财物，行政机关应当妥善保管，不得使用或者损毁；造成损失的，应当承担赔偿责任。
对查封的场所、设施或者财物，行政机关可以委托第三人保管，第三人不得损毁或者擅自转移、处置。因第三人的原因造成的损失，行政机关先行赔付后，有权向第三人追偿。
因查封、扣押发生的保管费用由行政机关承担。
法律依据：《行政强制法》
第二十六条对查封、扣押的场所、设施或者财物，行政机关应当妥善保管，不得使用或者损毁；造成损失的，应当承担赔偿责任。