法律分析：在判决执行过程中，被告人的人身自由权受到了严重侵害，若要保护被告人的权益，需要依法采取一系列措施。其中，必须遵守法律规定的程序，确保被告人在刑罚执行期间的基本人权不受损害。
法律依据：
1.《宪法》第37条：“公民的人身自由不受侵犯。任何公民，非经法律程序批准，不受逮捕或者监禁。”
2.《刑事诉讼法》第七十三条：“判决确定后，公安机关、人民检察院、人民法院应当在法定期限内执行。”
3.《狱中监狱管理规定》第十五条：“对在押人员的人身自由，不得侵犯。”
4.《狱中监狱管理规定》第十六条：“对在押人员的人身自由，必须严格按照法定程序执行。”
保护被告人的人身自由权，是保护公民基本人权的重要内容。只有依法采取措施，确保判决执行过程中的合法性和公正性，才能有效维护被告人的合法权益。