法律分析：
在判决执行过程中，如果被告人拥有知识产权，则需要采取措施保护其权益。具体来说，可以通过以下途径进行保护：
1.提出异议：如果认为对方侵犯了自己的知识产权，可以向执行法院提出异议，要求中止或者终止执行程序。
2.申请财产保全：如果执行行为可能会损害被告人的知识产权，可以向执行法院申请财产保全，确保自己的知识产权不受到侵害。
3.提起诉讼：如果被告人认为执行行为侵犯了自己的知识产权，可以提起诉讼，要求撤回或者变更执行令。
法律依据：
1.《民事诉讼法》第八十九条规定：“当事人认为执行行为侵犯其合法权益的，可以向执行法院提出异议。”
2.《民事诉讼法》第一百三十二条规定：“当事人认为执行行为会损害其权益的，可以申请财产保全。”
3.《中华人民共和国知识产权法》第五十九条规定：“对侵犯知识产权的行为，权利人可以向人民法院提起诉讼，要求撤销或者变更执行令。”