申请国家农业项目扶持流程如下：
1、申领人向村委会与中国农业银行机构提出办卡申请；
2、村委会等合作机构核实申请人信息后，将申请材料批量提交所在地中国农业银行网点进行审核；
3、对于符合发卡条件的，进行批量开卡（但不激活），并将完成开卡的卡片及卡号清单交给村委会等合作机构；
4、村委会等合作机构将卡片发给申领人；
5、申领人持惠农卡、户口簿和居民身份证原件到中国农业银行网点办理卡片激活。
申请国家农业项目扶持所需材料如下：
1、企业的法人执照复印件等证件；
2、企业资产负债表等报表；
3、凡申报国家项目，都要求地方政府给予配套资金；
4、企业申请项目，大部分资金不够，企业可以申请贷款解决；
5、土地证明，企业使用土地，要有国土资源管理局出具的使用证明；
6、审核评估报告，当地银行出具的信用等级证明。
法律依据：《中华人民共和国农民专业合作社法》第六十五条
中央和地方财政应当分别安排资金，支持农民专业合作社开展信息、培训、农产品标准与认证、农业生产基础设施建设、市场营销和技术推广等服务。国家对革命老区、民族地区、边疆地区和贫困地区的农民专业合作社给予优先扶助。
县级以上人民政府有关部门应当依法加强对财政补助资金使用情况的监督。