一般情况下，工程合同纠纷通常可以约定管辖。建设工程合同纠纷一般是让合同约定的履行人民法院来进行管辖的，但是如果合同没有约定或者约定不明确的，那么通常会让发包人接受起诉所在地的人民法院来进行管辖。如果有两个以上的人民法院对该案子有管辖权的，原告可以向两个中的一个人民法院来提起诉讼。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》
第二十三条 因合同纠纷提起的诉讼，由被告所在地或合同履行地人民法院管辖。
第三十五条规定，两个以上人民法院都有管辖权的诉讼，原告可以向其中一个人民法院起诉；原告向两个以上有管辖权的人民法院起诉的，由最先立案的人民法院管辖。