农村合作医疗和医保在多个方面存在明显的区别。首先，参保对象不同，农村合作医疗保险主要针对农村户口居民，而社保则面向在职职工或城镇居民。其次，期限不同，农村合作医疗是交一年保一年，而社保中的医疗险需持续缴纳至少15年才能享受终身医保待遇。在报销比例方面，社保中的医疗保险相对较高。此外，农村合作医疗没有个人医保账户，而社保中的医疗保险则有。在覆盖人群方面，农村医保只有农民可以参加，而社保则包括用人单位和个人缴费建立的医疗保险基金。乡镇企业以及职工、城镇个体经济组织业主及其从业人员也被纳入社保范围内。在缴费方式上，农村医保是农民自愿参加，而社保则是用人单位和职工共同缴纳。最后，两者的报销范围也存在差异。
单位社保缴纳证明应当写明当事人的社保号、身份号、参保起止时间及缴费金额。社会保险缴纳证明是证明参保人参保的证明，参保人在办理社保卡、转移社保关系时需持有此证明。
农村合作医疗保险的费用标准因地区经济条件而异，每年每人应交纳的最低费用不低于10元。经济条件较好的地区可以提高缴费标准。缴费标准目前设为每年100元、200元、300元、400元、500元5个档次，地方可以根据实际情况增设缴费档次。参保人自主选择档次缴费，多缴多得。