蜡样芽孢杆菌活菌胶囊主要成分是无毒蜡样芽孢杆菌。主要用于婴幼儿腹泻，慢性腹泻、肠功能紊乱及肠炎的治疗。
地衣芽胞杆菌活菌胶囊主要成分是无毒地衣芽胞杆菌。用于细菌或真菌引起的急、慢性肠炎、腹泻。也可用于其他原因引起的胃肠道菌群失调的防治。
两种菌都属于益生菌，两种菌的作用功效差不多，但是作用机制却不同。
蜡样芽胞杆菌，进入肠道后，消耗肠道内的过多氧气，创造厌氧环境，促进厌氧菌的生长，调整肠道菌群失调，改善微生态环境，达到适于有益厌氧菌生存、抑制有害好氧菌的目的。
地衣芽孢杆菌，进入肠道后，对葡萄球菌、酵母样等致病菌有拮抗作用，而对双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌、消化链球菌有促进作用，从而调整菌群失调，达到治疗的目的。同时，可促进机体产生抗菌活性物质，杀灭致病菌。此外，通过夺氧生物效应使肠道缺氧，有利于厌氧菌的生长。
一般地衣芽胞杆菌作用要好一点。婴儿对药物的耐受性远不如成人，因此用益生菌来调理腹泻比较好。