几乎所有的药物都可引起不良反应，只是反应的程度和发生率不同。随着药品种类日益增多，药物不良反应的发生率也逐年增加。那么枯草杆菌二联活菌颗粒的不良反应有哪些？
枯草杆菌二联活菌颗粒为复方制剂，淡黄色细颗粒。主要成分是肠球菌和枯草杆菌，另外还含有维生素c、维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12、烟酰胺、乳酸钙、氧化锌等。枯草杆菌二联活菌颗粒适用于消化不良、食欲不振、营养不良，肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀、肠道内异常发酵、肠炎，使用抗生素引起的肠粘膜损伤等症。
肠球菌(Enterococcus)属肠球菌属，是人类和动物肠道正常菌群的一部分，通常在引起腹腔和盆腔感染所分离的混合菌丝中发现，既往认为肠球菌是对人类无害的共栖菌，但近年研究已证实了肠球菌的致病力。在需氧革兰阳性球菌中，它是仅次于葡萄球菌的重要院内感染致病菌，肠球菌亦可引起院外感染。肠球菌不仅可引起尿路感染、皮肤软组织感染，还可引起危及生命的腹腔感染、败血症、心内膜炎和脑膜炎等。
枯草芽孢杆菌菌体生长过程中产生的枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，这些活性物质对致病菌或内源性感染的条件致病菌有明显的抑制作用，还能迅速消耗环境中的游离氧，造成肠道低氧，促进有益厌氧菌生长，并产生乳酸等有机酸类，降低肠道PH值，间接抑制其它致病菌生长。
另外枯草杆菌二联活菌颗粒使用中可能出现的不良反应是：极罕见有服用后腹泻次数增加的现象，停药后可恢复。不可与抗菌药、铋剂、鞣酸、药用炭、酊剂等同服。与抗菌药同服可减弱其疗效;铋剂、鞣酸、药用炭、酊剂等能抑制、吸附活菌。