办理特殊病种流程以及相关材料：1、携带既往病史资料（出院记录，化验单，疾病相关检查报告单等）至门诊医生就诊，符合条件的患者，由医生填写基本医疗保险特殊病种证明及门诊治疗审批表。2、特殊病种审批表必须由二级以上定点医疗机构经治医师填写。3、医院办理完结后，患者或家属携带病史资料，医保卡，身份证（未成年人持户口本）和1寸照片2张。及以上医院相关病史资料到户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表，审批表到当地社保局审批并盖章。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》 第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。