自来水厂出售的自来水收入适用13%税率，也可以按6%简易征收办法计算应纳增值税额;收取的符合规定的污水处理费可以免征增值税，但应与其他应税收入分别核算。根据新规定，污水、垃圾及污泥处理劳务在缴税后返还70%，即需要缴纳30%的增值税;再生水产品缴税后返还50%，即需要缴纳50%的增值税，如果您所说的主营业务收入是含税的(即为贵公司收到的包括增值税的款项)，那么，您就要换算成不含税的，即:主营业务收入=收取的款项/(1+17%)
一、污水处理费和排污费区别：
1.污水处理费用和排污费用是两种不同的费用，城市管理不能同时以两种费用的形式向同一排放者征收费用。
2.污水处理费用由公共事业局征收，污水处理费用由环境保护部门征收。
3.费用侧重点不同，污染物排放费用是清除污染物所需的费用，污水处理费用是处理后污染物排放所需的费用。
4.污水处理费通常按排水量乘以单价征收，排水费按排水量征收。排污费是指不超过排污费和超过排污费。主要包括污水排放费、废气排放费、固体废物和危险废物排放费和噪音超标排放费。
二、污水处理费如何征税？
1.国有企业和事业单位:费用通常由自来水公司和当地环境保护局征收，由财政局专家管理，每月支付给污水处理厂，保证污水处理厂稳定运行。
2.私营企业:通常根据私营企业和当地政府签订的协议(合同)决定收费方式，为了保障城市污水处理率，政府通常代替征收。
3.收费标准:各地收费价格不同，一般在0.8元左右。
法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》 第二条 纳税人销售或者进口自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品税率为13%.
《财政部、国家税务总局关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知》 第三条 对属于一般纳税人的自来水公司销售自来水按简易办法依照6%征收率征收增值税，不得抵扣其购进自来水取得增值税扣税凭证上注明的增值税税款。
《财政部、国家税务总局关于资源综合利用及其他产品增值税政策的通知》 第二条 对污水处理劳务免征增值税。污水处理是指将污水加工处理后符合GB18918-2002有关规定的水质标准的业务。