一、申请工伤认定后赔偿办理机构是哪里
1、申请工伤认定后，赔偿办理机构有两种情况：
(1)、如果由工伤保险基金赔偿的，赔偿办理的机构是社会保险行政部门;
(2)、如果没有购买工伤保险的，劳动者可以向用人单位主张工伤赔偿。
2、法律依据：《中华人民共和国工伤保险条例》第五条、第六十二条
二、工伤赔偿纠纷怎么办
为了充分保护工伤纠纷各方当事人的合法权益，特别是保护工伤职工及其亲属的合法权益，我国的有关法律法规对工伤纠纷规定了多种解决途径。
(1)申请行政复议
根据有关规定，申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的;工伤职工或者其直系亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的，可以依法申请行政复议。
(2)提起行政诉讼
申请工伤认定的职工或者其直系亲属、该职工所在单位对工伤认定结论不服的，工伤职工或者其直系亲属对经办机构核定的工伤保险待遇有异议的，还可以依法直接提起行政诉讼。
(3)申请调解、仲裁或者提起民事诉讼或者协商解决
职工与用人单位发生工伤待遇方面的争议，按照处理劳动争议的有关规定处理。根据《劳动法》第77条的规定，用人单位与劳动者发生劳动争议，当事人可以依法申请凋解、仲裁、提起诉讼，也可以协商解决。
可见，就有关工伤待遇方面的争议，可以协商解决，申请调解、仲裁或者提起民事诉讼。需要指出的是，提起民事诉讼之前必须先经过仲裁，否则法院不予受理。
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