法律分析：如果从保险险种来讲，是没有多少区别的。依据社会保险法的规定，职工应当参加基本养老、基本医疗、工伤、生育、失业保险。
灵活就业人员、不雇工的个体工商户、非全日制用工的劳动者可以参加基本养老和基本医疗保险，自己承担社会保险费。
(1)
缴费基数问题。相同缴费年度的情况下，缴费基数越高，退休待遇越高。灵活就业人员可以自我选择缴费基数，用人单位一般不允许自己选择，应当按照法律规定确定缴费基数。
用人单位确定缴费基数，一般是用人单位发给职工的上年度各种工资奖金的月均值。如果不是这样，那么用人单位就是违法行为，劳动者可以维权。
(2)承担钱数问题。用人单位缴纳社保的话，职工承担职工部分，企业承担企业部分。而灵活就业人员缴纳社保一般是本人需要承担企业和职工部分。
(3)退休后去世的待遇问题。由于个人账户的构成是本人缴费基数的8%划入。由于灵活就业人员交费是20%，会有12%不会退还，有可能会损失本金。
(4)特殊政策问题。还有一些地方对灵活就业人员推出了只交统筹医疗账户的优惠医疗保险，他们退休时不能够享受职工医疗保险个人账户部分。
(5)
退休年龄问题。很多地区女性灵活就业人员退休年龄是55周岁，但是在企业参保的工人身份人员，退休年龄就可以是50岁。这也是一个很重要的因素，晚领五年养老金，对于低收入人群影响非常大。
法律依据：《社会保险法》第十一条，基本养老保险实行社会统筹与个人账户相结合。
基本养老保险基金由用人单位和个人缴费以及政府补贴等组成。
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