法律分析：
工程款超过三年，可以起诉。当事人对工程款有纠纷的，可以直接去人民法院提起民事诉讼，请求人民法院作出判决，人民法院应当进行审查，审查后，发现符合起诉条件的，应当准予立案审理，对于超过诉讼时效的案件，被告不提出时效抗辩的，人民法院应当继续对案件进行审理，有提出时效抗辩的，人民法院应当驳回起诉。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百二十三条 人民法院应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百一十九条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。
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