慢病毒载体构建及包装操作手册
目录
慢病毒收到后的注意事项
一、 整体实验流程 二、 实验材料
三、 慢病毒包装和浓缩 四、 感染目的细胞
附1. 汉恒生物慢病毒质粒列表
附2. 慢病毒滴度测定方法简介
附3. 慢病毒MOI感染参数
附4. 汉恒生物各病毒载体感染目的细胞比较
汉恒慢病毒载体构建及包装操作手册
慢病毒安全使用和注意事项
➢ 慢病毒安全使用注意事项(*非常重要!!!*) 1) 慢病毒相关实验请在生物安全柜(BL-2级别)内操作。
2) 操作病毒时请穿实验服,佩戴口罩和手套,尽量不要裸露双手及手臂的皮肤。
3) 操作病毒时特别小心病毒溅出。如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用 70%
乙醇加 1%的SDS溶液擦拭干净。接触过病毒的枪头,离心管,培养板,培养液请于84消毒液浸泡后统一处理。
4) 如需要离心,应使用密封性好的离心管,如有必要请用封口膜封口后离心。
5) 病毒相关的废弃物需要特殊收集,统一经高温灭菌处理。
6) 实验完毕用香皂清洗双手。
➢ 慢病毒收到后的注意事项 1) 慢病毒的储存
用户收到病毒液后在短期内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4 ℃保存(尽量一周内用完);如需长期保存请分装后放置于-80℃。
注:a.反复冻融会降低病毒滴度(每次冻融会降低病毒滴度10%-50%);在病毒使用过程中应尽量避免反复冻融,所以我们前期对病毒进行了分装(200 l/tube),收到后直接放置-80℃保存即可。
b.如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前重新测定病毒滴度。
2) 慢病毒的稀释
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用户需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用培养目的细胞用PBS或无
血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后置于4℃保存(请尽量一周内用完)。
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一、 整体实验流程
二、 实验材料
(一)慢病毒载体、包装细胞和菌株
该病毒包装系统为三质粒系统,组成为psPAX2, pMD2.G, pHBLVTM系列质粒。
1、载体信息(见附表1)
2、细胞株:我们采用293T作为慢病毒的包装细胞。该细胞系为贴壁依赖型成上皮样细胞,生长培养基为DMEM+10% FBS+双抗。贴壁细胞经培养生长增殖形成单层细胞。
3、菌株:大肠杆菌菌株DH5α用于扩增辅助包装载体质粒;Stbl3用于扩增pHBLVTM
系列质粒,防止病毒载体重组。
三、 慢病毒包装和浓缩
(一) 质粒扩增
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构建好的慢病毒载体和辅助质粒需经过大量抽提,浓度大于1 g/l,A260/280在
1.7-1.8间方可用以病毒包装。推荐使用Qiagen大抽试剂盒进行质粒的大量去内毒素抽提(质粒质量会极大影响后续转染效率和病毒的滴度)。
(二) 做脂质体转染
转染前一天,按照5106/T75的密度铺下293T细胞。24h后转染。转染前请把DMEM和转染试剂LipoFiterTM恢复至室温,使用前需摇匀。转染每瓶T75的质粒成分如下:
psPAX2 PMD2.G pHBLVTM系列载体 10 μg 10 μg 10 μg 请参考LipoFiterTM转染试剂说明书进行转染操作。转染后6 h换新鲜培养基。
注:LipoFiterTM转染试剂为汉恒生物研制的DNA转染试剂产品,使用说明请参考LipoFiterTM说明书。
(三) 病毒收集和离心
转染后48h和72h分别两次收集病毒上清(48h收集后置换新鲜培液),收集后以0.45 μm滤器过滤,于40 ml超速离心管中,4℃,72000g离心120 min。
(四) 病毒重悬和保存
500 l 新鲜培养液重悬病毒沉淀,置于-80℃甚至液氮保存。
四、 感染目的细胞
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(一) 细胞准备
将状态良好的目的细胞接种到24孔板,使细胞浓度为1×105/ml细胞,接种细胞数量因细胞的生长速度而略有不同,一般是保证第二天进行病毒感染的时候细胞汇合率介于50%至70%之间。
(二) 病毒感染
1. Polybrene的选择:
Polybrene是带正电的小分子,与细胞表面的阴离子结合,提高慢病毒对细胞的感染效率,通常加入polybrene能提高感染效率2~10倍。
Polybrene有一定的细胞毒性,有的细胞对Polybrene的毒理反应明显,因此细胞感染时是否适合Polybrene需要摸索;不同细胞对Polybrene的敏感度不同,可以用1~10μg/ml的范围筛选合适的浓度,以24h内细胞无明显毒性反应为佳,可参考文献并进行预实验摸索,Polybrene最常用的工作浓度为6~8 μg/ml。
注:1)汉恒生物的自产的Polybrene 产品,用户可用以进行辅助感染。提供的Polybrene母液保存在-20℃(可保存1年以上),避免反复冻融3次以上,否则活性受影响。4℃可保存2周。
2)Polybrene预实验请先使用对照病毒进行摸索,部分细胞系MOI及Polybrene 的使用范围
请参见附表3。
2. 感染细胞最佳MOI的测定
MOI(Multiplicity of Infection,感染复数)是指每个细胞感染的病毒数,通常MOI越高,病毒整合到染色体的数量以及目的蛋白的表达量越高。对于分裂活跃的细胞,比如
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Hela、293细胞,MOI=1~3时,80%以上的细胞均表达目的基因。而对于非分裂细胞,比如原代细胞,感染效率较低。需要进行MOI梯度摸索实验,选择适合的MOI进行实验。
3. 感染步骤
按实验需要将细胞铺板(比如12孔板)。细胞数以第2天密度约50%为宜。37℃ 培养过夜。
对于Polybrene可施加的细胞:准备完全培养基和 Polybrene混合物,Polybrene 终浓度为摸索得到的最适终浓度。移去培养基并添加 0.5 ml Polybrene/培养基混合物于每孔中(适用于 24 孔板,其他孔板请相应调整体积。)
注:对于不适用Polybrene的细胞,以上步骤省略,直接进入下面步骤。
感染前,从冰箱取出并在冰上慢慢融化病毒,吸去细胞原有培养基,加入1/2体积新鲜培养基,再将病毒原液加入细胞中,轻轻混匀。(具体加入的病毒数可参考附表1)37℃小体积感染4 h,4 h后补齐培养基至正常体积。(感染时培养基体积表格如下)
病毒小培养体积感染表 培养皿类型 96-well 24-well 12-well 6-well 表面积/cm2 0.3 cm2 2 cm2 4 cm2 10 cm2 培养基体积 100 µl 500 µl 1 ml 2 ml 病毒体积 50 µl 250 µl 500 µl 1 ml 慢病毒感染4 h后补足至培养体积,感染24 h后换液,腺病毒感染4-8 h后直接换液
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感染后第二天(约24 h),吸去含病毒的培养液,换上新鲜的完全培养液,继续37℃
培养。
感染后48 h,对于带GFP报告基因的病毒,可通过荧光显微镜观测GFP表达效率,对于携带Puromycin抗性基因的病毒,换上含适当浓度Puromycin的新鲜完全培养液,筛选稳定转导的细胞株(详见下方)。
注意: 融化的病毒置于冰上。反复冻溶或长时间将病毒颗粒暴露于常温可使病毒效价降低。
4. Puromycin抗性筛选
Puromycin标准的施加终浓度范围为1~10 μg/ml,不同细胞puromycin的工作浓度不同,请查找相关文献(部分细胞参考用量见下图),另外请设不感染筛选对照(未经过病毒感染的野生型细胞),加入等量等浓度的Puromycin。
部分细胞Puromycin参考值:
Cell line 293系列 HeLa B16 PC1.0 MC3T3-E1 H9C2 Species Human Human Mouse Hamster Mouse Rat Puromycin (µg/ml) 3 3 1-3 10 10 1
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MCF-7 MDA-MB-××× HepG2 HT1080 A549 H1299 Human embroyonic stem cellsHuman (Human ESCs) 1 Human Human Human Human Human Human 1-3 1-3 2 1 1.5 2 更多Puromycin使用浓度更新中,详情请参考公司网站www.hanbio.net.
每2-3天更换一次含有Puromycin的完全培养液,直至没有感染病毒的对照组细胞被Puromycin杀光,然后可进行以下两步操作(依照具体实验需要选择)。
1) 不挑取单克隆
将感染并筛选后的细胞进行传代,并继续施加Puromycin进行维持性筛选培养。连续筛选并传3代后,冻存保种细胞Mixture(这种Mixture由于各个细胞的不均一性,有时候表型可能不是太好,建议做单克隆挑取)。
2) 挑取单克隆
将感染并筛选后的细胞挑选至少5个克隆进行细胞扩增,并继续施加Puromycin进行维持性筛选培养。扩增完毕后Western blot或者qPCR检测目的蛋白或基因的表达。挑取表达量适中的稳定细胞株,连续筛选并传3代后,冻存保重稳定细胞株。
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5. 感染悬浮细胞
感染悬浮或半悬浮细胞,则需要通过平角离心转染法,即将适量的病毒液加入细胞培养皿后,封好口,放入平角离心机后,低速(200g)离心1 h,然后放入培养箱中正常培养即可。若由于实验条件有限,没有平角离心机,可用离心管代替,将细胞吹打吸入离心管中,进行低速离心,去掉大部分上清,然后加入适量的病毒液,室温放置15 min(尽量不要超过30 min),然后将细胞和病毒液同时吸出转入培养皿中继续病毒感染过夜后换液即可。
6. 对于极难感染的细胞
对于极难感染的细胞,如DC(树突状细胞)等,可采用多次感染的方法,即感染24 h后,更换新鲜病毒进行二次感染,可显著提升感染效率。
7. 传代能力较差的原代细胞
对于一些传代能力较差的原代细胞,比如BMSC等,建议采用滴度更高的腺病毒进行感染。
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附1:汉恒生物慢病毒质粒列表(质粒图谱请登陆汉恒官网www.hanbio.net查询)
载体名称 pHBLv-CMV-MCS-EF1-RFP-T2A 用途 启动子 容量 抗药标记 荧光标记 过表达 -puro pHBLv-CMV-MCS-EF1-ZsGreen 过表达 -T2A-puro pHBLV-CMV-MCS-EF1-Luc-T2A 过表达 -Puro pHBLV-CMV-MCS-EF1-Puro pHBLV-CMV-MCS-T2A-Puro pHBLV-CMV-MCS-T2A-ZsGree过表达 n pCDH-CMV-MCS-EF1-RFP-T2A 过表达 -Puro pCDH-CMV-MCS-EF1-GFP-T2A 过表达 -Puro Tet-on过表pHBLV-Tet-on-SV40-puro 达 pHBLV-CMV-crRNA-EF1-GFP-T2A-puro pHBLV-U6-MCS-EF1-mCherry-环状RNA过过表达 过表达 CMV 2.5kb Puromycin RFP CMV 2.5kb Puromycin ZsGreen CMV 2.0kb Puromycin Luc CMV CMV 3.0kb 3.0kb Puromycin Puromycin 无 无 CMV 3.0kb 无 ZsGreen CMV 3.0kb Puromycin RFP CMV 2.5kb Puromycin GFP TRE31.5kb G Puromycin 无 CMV 表达 干扰 U6 2.5kb 无 GFP shRNPuromycin mCherry
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T2A-puro A shRN干扰 PGK-Puro U6 A shRN干扰 -Puro U6 A shRN干扰 2A-Luc U6 A shRN干扰 uc U6 A shRN干扰 la U6 A shRNBlasticidin Luc 无 RFP/Luc 无 /Luc ZsGreenPuromycin Luc Puromycin ZsGreen pHBLV-U6-MCS-CMV-ZsGreen-pHBLV-U6-MCS-EF1-Luc-T2A pHBLV-U6-MCS-EF1-ZsGreen-TpHBLV-U6-MCS-EF1-RFP-T2A-LpHBLV-U6-MCS-EF1-Luc-T2A-BpHBLV-U6-MCS-CMV-ZsGreen 干扰 U6 A shRN无 ZsGreen pHBLV-U6-MCS-PGK-puro 干扰 U6 A Puromycin 无 pHBLV-EF1-cas9-U6-gRNA-puCas9/gRNA ro pHBLV-EF1-cas9-CMV-puro pHBLV-U6-gRNA-EF1a-puro cas9 gRNA EF1/U6 EF1 U6 Cas9/ Puromycin gRNA Cas9 gRNA Puromycin Puromycin 无 无 无
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附2:慢病毒滴度测定方法简介(表达荧光的慢病毒)
Day 0: 将生长状态良好的 293T 细胞消化计数后稀释至1105/ml, 加入96孔板,
100 l/孔(1104 个细胞),每种病毒需要6个孔。放入37℃,5% CO2 培养箱中培养过夜。
Day 1: 在 EP 管中做10倍梯度稀释,连续6个稀释度。稀释方法如下:每种病毒准
备6个1.5 ml EP 管,每管加入90 l完全培养基,往第一个管中加入10 l病毒原液,混匀后,吸取10 l 加入第二个管混匀。以此类推。然后把稀释好的病毒和细胞孵育过夜。
Day 2:吸去带有病毒的培养液,在每个孔中再加入100 l 完全培养液,以利于细胞
的生长。
Day 3:显微镜观察荧光。此时荧光会有初步表达。
Day 4:在荧光显微镜下观察结果,对荧光比例合适(10-30%之间)的孔进行细胞计
数,并计算滴度。其计算公式如下:
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滴度(TU/ml)=细胞数荧光百分比103/病毒原液体积 (l)。
举例:③号管对应孔的荧光比例为30%,细胞总数为8104,
滴度(TU/ml)=810430%103/0.1=2.4108
如果要感染2×105个细胞,MOI=30(1个细胞对应30个病毒粒子)(见下注),则需要病毒体积为=2×10530/2.4108(ml)=0.025 ml=25 l.
注:MOI值: MOI 是multiplicity of infection的缩写,中文译为感染复数,实际的含义即为每个细胞被多少个有活力病毒所感染。各种细胞的最适MOI值有差别,请客户正式实验前先进行预实验摸索最适MOI。
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附3:慢病毒MOI感染参数
注:不同实验室由于细胞的来源、代数和细胞状态等因素的影响,MOI值也略有差异,以下数据是在
细胞感染效率在85-100%细胞状态良好的情况下获得的,仅供参考。
细胞系 K562 Jurkat kasumi NB4 U937 THP-1 GBC-SD H929 H1299 95D A549 SPC-A-1 7402 Hep 3B Hep G2 SMMC-7721 Huh-7 Hela 细胞描述 人白血病细胞 人白血病细胞株 人白血病细胞株 人白血病细胞株 人单核细胞 人单核细胞株 人胆囊癌细胞株 人多发性骨髓瘤症细人非小细胞性肺癌细人肺巨细胞癌 人肺腺癌 人肺腺癌细胞 人肝癌细胞 人肝癌细胞 人肝癌细胞 人肝癌细胞 人肝癌细胞系 人宫颈癌细胞株 MOI值范围 20~40 50~80 10~30 50~80 20~40 50~80 30~50 100~150 1~3 2~4 20~40 100~150 10~15 10~30 10~30 10~30 10~30 10~30 能否添加可 不可 不可 不可 可 可 不可 不可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可
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HOS Hep-2 HL-60 HT-29 PKO SW480 DLD-1 SK-OV-3 SHG-44 U251 U87 293T HUVEC-2C PC-3 MDA-MB-231 MCF-7 Tca8113 RPE AGS BGC-823 SGC-7901 MKN-28 人骨肉瘤细胞系 人喉癌细胞株 人急性髓系白血病细人结肠癌细胞 人结肠癌细胞 人结肠癌细胞株 人结直肠肿瘤细胞株 人卵巢癌细胞株 人脑胶质瘤细胞 人脑胶质母细胞瘤 人脑星型胶质母细胞人胚肾上皮细胞 人脐静脉血管内皮细人前列腺癌细胞 人乳腺癌细胞 人乳腺癌细胞株 人舌鳞状细胞癌 人视网膜色素上皮细人胃癌细胞 人胃癌细胞 人胃癌细胞 人胃癌细胞株 20~40 10~30 >100 10~30 2~4 10~30 10~30 2~4 10~30 1~3 1~3 1~3 10~30 20~40 10~30 20~40 10~30 10~30 100~150 100~150 10~30 20~40 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 可 不可 可 可 可 可 可 可
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MKN-45 BxPc-3 CFPAC-1 Panc-1 HEC-1-B NIH-3T3 Raw264.7 CHO HSC-T6 C6 NRK 人胃低分化腺癌细胞人胰腺癌细胞 人胰腺癌细胞 人胰腺癌细胞 人子宫内膜癌细胞株 小鼠成纤维细胞系 小鼠单核巨噬细胞白中国仓鼠卵巢细胞 大鼠肝星型细胞 大鼠脑胶质瘤细胞 大鼠肾细胞 20~40 20~40 50~80 2~4 2~4 20~40 10~30(感染后分化) 20~40 10~30 >100 10~30 可 可 可 可 可 可 不可 可 不可 可 可
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附4:汉恒生物各病毒载体感染目的细胞比较
感染方式 换液时间 慢病毒 逆转录病毒 直接加入 感染后24 h 腺病毒 感染后4-8 h 不需要,腺病毒感染能力很强 需要筛选获得稳定感染株,慢病毒的感染是否需要筛选 能力不强 带有GFP等荧光标签,48-72 h后可以观察到表达;若不带有观察时间 荧光标签,则需要qPCR或者WB鉴定 有时需要,但是根据具体情况操作,因为助转剂,如polybrene,是否需要助转剂 对细胞的伤害比较大,有的细胞可能承受不了
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